組織架構

本分署下設森林管理科、經營企劃科、森林育樂科、自然保育科、集水區治理科計5個業務單位，及秘書室、人事室、主計室、政風室計4個行政單位；現場作業單位則有關山、知本、大武、成功計4個工作站。

單位簡介

單位	負責業務
森林管理科	林地管理： 辦理國有林地籍管理、租地造林管理等 森林保護： 辦理防救森林火災、防範與取締盜伐濫墾案件 林業推廣： 辦理林業宣傳刊物編輯、植樹節活動、林業新聞發布等 保安林經營管理
經營企劃科	林業計畫彙報 森林資源調查及樣區調(複)查 國有林事業區檢訂及其經營計畫擬訂與執行 航空照片、林區像片基本圖等圖資之管理 國有林森林登記業務 一般資訊及地理資訊系統工作之執行與綜合管理 造林及育苗計畫、實施進度之編擬及執行 森林病、蟲、動物為害之調查、研究及防治 平地造林計畫 公私有林經營及林業永續多元輔導 獎勵造林計畫 林產處分業務
森林育樂科	服務業務： 辦理森林遊樂區經營管理、森林遊樂解說及環境教育等  森林遊樂業務： 規劃森林遊樂區之設置、規劃及維護等
自然保育科	保育業務:  辦理自然保護(留)區經營管理等 野生動、植物資源管理業務:  辦理野生動、植物資源調查及保護等 社區林業 農村再生計畫、補助地方政府自然保育計畫等
集水區治理科	辦理治山防災工程、林道網整建與維護
秘書室	辦理庶務、文書檔案、管制考核作業、採購招標管理作業
人事室	辦理組織編制事項、獎懲、考績、訓練進修及勞基法相關業務等
主計室	辦理預算籌編及決算之編製、帳務處理、內部審核等
政風室	廉政之宣導及社會參與。 廉政法令、預防措施之擬訂、推動及執行。 廉政興革建議之擬訂、協調及推動。 公職人員財產申報、利益衝突迴避及廉政倫理相關業務。 機關有關之貪瀆與不法事項之處理。 對於具有貪瀆風險業務之清查。 機關公務機密維護之處理及協調。 機關安全維護之處理及協調。 其他有關政風事項。